Bacterias incoloras del azufre: responsables de la fijación del SH2 procedente de la descomposición de la materia orgánica, que abunda en aguas residuales.

Bacterias del nitrógeno: oxidan compuestos reducidos del nitrógeno, como el amoniaco, procedente de la descomposición de cadáveres animales y de restos vegetales, y los convierte en nitratos asimilables por las plantas.

Bacterias del hierro: transforman los depósitos minerales de carbonatos de hierro en yacimientos de óxidos de hierro.

Bacterias del hidrógeno: pueden utilizar hidrógeno molecular y son quimioautótrofos facultativos.