Descripción y comentarios:

El monasterio fue erigido por orden de Juan López Lazarraga, Contador Mayor de los Reyes Católicos; tanto él como su esposa Juana Gamboa fueron sepultados en el convento. Las obras de construcción comenzaron el año 1510, en los terrenos de la casa, puesto que el Conde de Oñati no les permitió construir el sepulcro en la iglesia San Miguel.

El edificio no presenta mucha ornamentación, está construido con piedra sin labrar; consta de patio y claustro; precisamente, rodeando el claustro es donde se disponen las habitaciones, salas y el resto; está ubicado en la parte norte de la iglesia.

Edificio sencillo, con escasos elementos decorativos, presenta planta rectangular , y las capillas están dispuestas entre los contrafuertes . La única ornamentación que se presenta de cara al exterior es la cornisa , de doble hilera de bolas, y que continúa hasta el convento, decoración muy característica de la época de los Reyes Católicos. Uno de los escudos de armas de los monarcas, de fina talla, rodea el escudo de los franciscanos, y sujetando todo el conjunto, aparecen dos ángeles.

La portada mayor se ubica en el muro orientación norte, y muestra la transición del estilo gótico al renacentista. La puerta de acceso está enmarcada por tres arcos carpaneles con arquivoltas, y los arcos dispuestos sobre la puerta forman el tímpano , donde se hallan las esculturas del Eterno Padre, de Santa Clara y San Francisco, los dos últimos en posición de oratoria. En los laterales de la puerta aparecen las imágenes de San Pedro y San Pablo, ambos en postura bastante rígida. También se pueden apreciar los escudos de armas de los linajes de Lazarraga y los Gamboa. La puerta de la entrada principal es adintelada. Sobre la fachada se abre la espadaña , formada por tres cuerpos escalonados.

En cuanto al interior, está construido en estilo gótico, es de planta de cruz latina , y una única nave dividida en cuatro tramos. En la parte superior, sobre un gran arco conopial se ubica el coro. Se cubre con una fina bóveda de crucería , que se presenta ornamentada con nervios diagonales y terceletes . Los escudos de armas de los Reyes Católicos y de la Orden se muestran en las claves de la nave central y en las capillas de ambos fundadores.

El suelo es de madera, y es precisamente donde se hallan los sepulcros de los componentes de la comunidad. Los sepulcros de los fundadores son de aspecto sencillo, refinado y están cubiertos con una losa de gran tamaño, adornada con los dos escudos de armas de los fundadores. El retablo actual fue realizado en la ciudad Medina de Pomar, en estilo barroco, es de madera sin dorado.

El monasterio se dispone en torno al patio, y consta de dos alturas: el inferior porticado y adintelado, y el superior, fijado entre columnas, dispone de arcos semicirculares . En el cuerpo superior, prevalece el ladrillo y maderamen, y muestra claramente la influencia del estilo mudéjar.