Los fondos de heráldica que alberga este museo, ubicado en la Torre de Mendoza, provienen de dos fuentes. Algunas son producto de una campaña sistemática de recogida de escudos que estaban en peligro de desaparición por la provincia, mientras que otras han llegado a esta torre gracias a donaciones particulares.

Los más de cuarenta escudos con los que cuenta el museo están instalados en la planta baja de la torre y adosados a los muros interiores del recinto amurallado. Mientras que la planta primera se puede considerar como homenaje a las siete Cuadrillas de Álava, situándose un espacio de visionado de programas de heráldica.

En la planta segunda y tercera se exponen de forma gráfica diversos temas generales de heráldica, apellidos, linajes y su interpretación.