Su primera sede fue una antigua sala de exposiciones de automóviles. Sin embargo, el filántropo Solomon Guggenheim y la consejera de arte Hilla Rebay tenían muy claro que querían mostrar un nuevo concepto del arte en un nuevo lugar. La primera sede permanente la construyó Frank Lloyd Wright. Levantó un edificio en el que predominaban las líneas curvas. Éste lugar abrió sus puertas en 1959, atrajó a mucha gente y provocó grandes discusiones. En 1992 restauraron el edificio y le agregaron una nueva torre. En la misma época abrieron el museo Guggenheim de Soho, en Manhattan. Para el futuro, han decidido contruir otro edificio diseñado por Frank Gehry, para organizar exposiciones singulares y para poner en marcha nuevas actividades.