Xavier Zubiri Fundazioa 1989ko apirilaren 17an eratu zen. Horren aurretik Fundazio zabalago baten barruan egon zen. Zubiriren beraren borondatez, pentsalariaren filosofia-ondarearen gordetzailea da. Zubiriren emazte eta Américo Castro historialari handiaren alaba Carmen Castrok utzitako Américo Castroren eskubideak ere jarauntsi ditu Fundazioak.